Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms