Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
STRN3Q13033 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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