Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms