Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms