Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms