Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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