Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms