Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PKHD1P08F94 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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PKHD1P08F94 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PKHD1P08F94 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKHD1P08F94 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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