Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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BRPF3Q9ULD4 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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BRPF3Q9ULD4 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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BRPF3Q9ULD4 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRPF3Q9ULD4 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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