Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms