Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSRB1Q9NZV6 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms