Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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GDE1Q9NZC3 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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GDE1Q9NZC3 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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GDE1Q9NZC3 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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GDE1Q9NZC3 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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