Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TM6SF1Q9BZW5 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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TM6SF1Q9BZW5 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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TM6SF1Q9BZW5 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TM6SF1Q9BZW5 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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