Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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