Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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