Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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