Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms