Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms