Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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