Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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