Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms