Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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