Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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