Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SP140Q13342 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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