Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RIGQ13278 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RIGQ13278 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RIGQ13278 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RIGQ13278 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RIGQ13278 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RIGQ13278 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RIGQ13278 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms