Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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