Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms