Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXD4Q12950 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXD4Q12950 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXD4Q12950 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXD4Q12950 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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