Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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