Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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