Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms