Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms