Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms