Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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