Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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SMG1Q96Q15 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
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SMG1Q96Q15 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMG1Q96Q15 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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