Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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BCANQ96GW7 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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BCANQ96GW7 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
BCANQ96GW7 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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