Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms