Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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