Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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GEN1Q17RS7 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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GEN1Q17RS7 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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GEN1Q17RS7 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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GEN1Q17RS7 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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GEN1Q17RS7 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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GEN1Q17RS7 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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GEN1Q17RS7 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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GEN1Q17RS7 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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GEN1Q17RS7 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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