Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP6Q16828 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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