Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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