Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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SSX1Q16384 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.09
SSX1Q16384 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SSX1Q16384 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SSX1Q16384 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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SSX1Q16384 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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SSX1Q16384 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSX1Q16384 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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