Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZIC1Q15915 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms