Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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SCN9AQ15858 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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SCN9AQ15858 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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SCN9AQ15858 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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SCN9AQ15858 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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SCN9AQ15858 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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SCN9AQ15858 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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SCN9AQ15858 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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