Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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