Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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