Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SS18Q15532 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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