Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
MDC1Q14676 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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