Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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