Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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